生于１９４４年１２月，福建福州市人，１９７９年１１月加入中国共产党，１９６８年１２月参加工作，复旦大学生物系动物及人体生理专业毕业，大学文化，高级工程师。

　　１９９１年２月至１９９４年４月先后任浙江省总工会副主席、党组副书记、主席、党组书记。１９９４年４月至１９９８年３月任国家医药管理局局长、党组书记。１９９８年３月任国家药品监督管理局局长、党组书记。２００３年５月任国家食品药品监督管理局局长。

　　２００５年６月，郑筱萸被免去国家食品药品监督管理局局长职务。

　　２００７年２月２８日，政协十届常委会第十六次会议决定，撤销郑筱萸全国政协委员资格。同年３月１日，中央纪委监察部公布，郑筱萸严重违纪受到开除党籍、行政开除处分。对其涉嫌犯罪问题移送司法机关依法处理。