美军的司令部分为按地理划分的战区司令部和按职能划分的职能司令部。
战区司令部包括:太平洋司令部,辖区包括亚太地区、美国西海岸和阿拉斯加以及南极洲大陆等;欧洲司令部,辖区包括欧洲大陆、非洲的绝大部分地区、地中海地区、俄罗斯本土、格陵兰岛以及北极地区;中央司令部,辖区包括中东、中亚和东非地区;南方司令部,辖区包括墨西哥的南部,加勒比海南部、南美洲大陆等拉美地区;北方司令部,主要负责美国本土安全。
职能司令部包括:联合部队司令部,负责美军联合作战训练;特种作战司令部,负责组织和实施特种作战行动;战略司令部,负责指挥美国战略核力量;运输司令部,负责协调、投送和维持美军所需的人员和战略资源。